MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	480533969
2	NC_021026	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	480533969
3	NC_021026	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533969
4	NC_021026	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480533969
5	NC_021026	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533969
6	NC_021026	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
7	NC_021026	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533969
8	NC_021026	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533969
9	NC_021026	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	480533969
10	NC_021026	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533969
11	NC_021026	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
12	NC_021026	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	480533969
13	NC_021026	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	480533969
14	NC_021026	AT	3	6	731	736	50 %	50 %	0 %	0 %	480533969
15	NC_021026	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
16	NC_021026	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533969
17	NC_021026	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	480533969
18	NC_021026	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533969
19	NC_021026	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533969
20	NC_021026	A	8	8	1184	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	480533969
21	NC_021026	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533969
22	NC_021026	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533969
23	NC_021026	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	480533969
24	NC_021026	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	480533969
25	NC_021026	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	480533969
26	NC_021026	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	480533969
27	NC_021026	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	480533969
28	NC_021026	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533969
29	NC_021026	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533970
30	NC_021026	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	480533970
31	NC_021026	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533970
32	NC_021026	AG	3	6	1761	1766	50 %	0 %	50 %	0 %	480533970
33	NC_021026	A	7	7	1884	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	480533970
34	NC_021026	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
35	NC_021026	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
36	NC_021026	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
37	NC_021026	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
38	NC_021026	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	480533970
39	NC_021026	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533970
40	NC_021026	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533970
41	NC_021026	AG	3	6	2173	2178	50 %	0 %	50 %	0 %	480533970
42	NC_021026	A	6	6	2267	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	480533970
43	NC_021026	A	7	7	2283	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	480533970
44	NC_021026	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
45	NC_021026	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
46	NC_021026	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533970
47	NC_021026	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533970
48	NC_021026	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	480533970
49	NC_021026	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533970
50	NC_021026	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	480533970
51	NC_021026	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	480533970
52	NC_021026	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533970
53	NC_021026	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533971
54	NC_021026	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	480533971
55	NC_021026	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	480533971
56	NC_021026	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533971
57	NC_021026	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533971
58	NC_021026	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533971
59	NC_021026	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
60	NC_021026	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
61	NC_021026	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533972
62	NC_021026	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	480533972
63	NC_021026	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
64	NC_021026	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	480533972
65	NC_021026	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533972
66	NC_021026	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
67	NC_021026	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
68	NC_021026	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	480533972
69	NC_021026	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
70	NC_021026	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
71	NC_021026	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
72	NC_021026	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	480533972
73	NC_021026	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	480533972
74	NC_021026	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	480533972
75	NC_021026	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
76	NC_021026	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533972
77	NC_021026	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
78	NC_021026	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533972
79	NC_021026	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
80	NC_021026	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
81	NC_021026	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	480533972
82	NC_021026	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	480533973
83	NC_021026	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	480533973
84	NC_021026	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	480533973
85	NC_021026	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533973
86	NC_021026	AC	3	6	4485	4490	50 %	0 %	0 %	50 %	480533973
87	NC_021026	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	480533973
88	NC_021026	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	480533973
89	NC_021026	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533973
90	NC_021026	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
91	NC_021026	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533973
92	NC_021026	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533973
93	NC_021026	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
94	NC_021026	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533973
95	NC_021026	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533973
96	NC_021026	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
97	NC_021026	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533973
98	NC_021026	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
99	NC_021026	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	480533974
100	NC_021026	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533974
101	NC_021026	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480533974
102	NC_021026	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
103	NC_021026	TATC	2	8	5146	5153	25 %	50 %	0 %	25 %	480533974
104	NC_021026	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
105	NC_021026	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533974
106	NC_021026	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	480533974
107	NC_021026	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	480533974
108	NC_021026	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
109	NC_021026	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	480533974
110	NC_021026	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
111	NC_021026	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533974
112	NC_021026	T	6	6	5523	5528	0 %	100 %	0 %	0 %	480533974
113	NC_021026	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
114	NC_021026	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	480533974
115	NC_021026	GA	3	6	5630	5635	50 %	0 %	50 %	0 %	480533974
116	NC_021026	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
117	NC_021026	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
118	NC_021026	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
119	NC_021026	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
120	NC_021026	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	480533974
121	NC_021026	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	480533974
122	NC_021026	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	480533974
123	NC_021026	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
124	NC_021026	A	7	7	6120	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	480533974
125	NC_021026	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
126	NC_021026	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533974
127	NC_021026	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533974
128	NC_021026	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533974
129	NC_021026	AG	3	6	6380	6385	50 %	0 %	50 %	0 %	480533974
130	NC_021026	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533974
131	NC_021026	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533974
132	NC_021026	AT	3	6	6569	6574	50 %	50 %	0 %	0 %	480533974
133	NC_021026	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	480533974
134	NC_021026	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
135	NC_021026	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	480533974
136	NC_021026	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
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268	NC_021026	ATG	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533981
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270	NC_021026	GTA	2	6	12870	12875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533981
271	NC_021026	AGC	2	6	12883	12888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533981
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